نظر به اینکه برخی از جرایم مالیاتی مقرر در قوانین مربوطه — از جمله جرایم موضوع مواد ۱۹۰، ۱۹۲ و ۱۹۳ قانون مالیات‌های مستقیم، جرایم موضوع بندهای «الف»، «ب» و «ج» ماده ۳۶ (حسب مورد)، و همچنین ماده ۳۷ قانون مالیات بر ارزش افزوده مصوب ۱۴۰۰ — بر مبنای مبلغ مالیات قطعی‌شده مؤدیان و یا مالیات و عوارض پرداخت‌نشده تا موعد مقرر و یا مالیات و عوارض دریافتی محاسبه می‌گردد، لذا چنانچه طی فرآیندهای قانونی حل اختلاف، مبالغ مالیات و یا مالیات و عوارض تعدیل شود، به تناسب آن میزان جرایم مالیاتی مذکور که به واسطه مبالغ اولیه مالیات قبل از تعدیل محاسبه شده، می‌بایست تعدیل شود.

لیکن بعضاً مشاهده می‌شود در موارد فوق، تعدیل جرایم مالیاتی از سوی مأموران مالیاتی منوط به شرایطی مانند تصریح موضوع در متن رأی هیئت یا اصلاح رأی مذکور می‌گردد که این امر موجب بروز نارضایتی مؤدیان مالیاتی شده است.